消毒除臭服务企业多属于服务型消毒相关企业，其资质证书通常向国家认监委备案的行业协会或第三方认证机构申请办理，部分地区流程可能略有差异，整体办理流程及过程如下：

明确资质类型并选定办理机构：首先要确定需办理的具体资质等级，不同等级资质对应不同的服务能力和标准要求。之后挑选正规办理机构，优先选择中国卫生有害生物防制协会等国家认监委备案的行业协会，或是合规的第三方认证机构，提前确认机构的资质审核标准和相关流程细节。

整理并提交申请材料：先填写机构提供的对应资质申请表，再搭配各类材料装订成册。材料通常包含三证合一的营业执照副本复印件，且经营范围需含消毒服务相关内容；固定办公场地的产权证明或租赁合同；消毒服务流程、人员培训制度等管理体系文件；消毒操作人员的健康证、消毒员资格证，还有消毒设备清单及购置发票、近期的消毒服务合同等。准备完毕后，可通过机构线上系统上传材料，也能线下现场递交或邮寄纸质材料。

材料审核与现场核查：机构收到材料后，会先核查材料是否完整、合规，若材料存在问题，会通知企业限期补正。材料审核通过后，多数机构会安排实地核查，重点查看办公场地布局、设备存放情况，同时抽查消杀台账、人员培训记录等资料，以此评估企业实际的服务能力是否达标。

整改复核（若有需要）：倘若现场核查发现企业存在消毒设备不足、管理制度不完善、人员资质不达标等问题，机构会出具整改通知。企业需按照通知要求及时调整优化，比如补充设备、完善制度、组织人员补学考证等，完成整改后提交整改报告，等待机构再次复核。

公示与领取证书：整改复核通过后，企业相关信息会在办理机构官网或行业相关平台进行公示，公示期内无异议的，企业即可前往机构领取消毒除臭服务企业资质证书。该证书有效期一般为 3 年，到期前需提前准备复审相关材料，办理续期手续。