民用无人驾驶航空器运营合格证办理最快20个工作日，根据《无人驾驶航空器飞行管理暂行条例》使用除微型以外的民用无人驾驶航空器从事飞行活动的单位应当申请取得民用无人驾驶航空器运营合格证。

随着低空经济概念走红，从事无人机相关活动的企业也越来越多，5月12日，在申请“民用无人驾驶航空器运营合格证”时发现，材料填报上传完成提交后，系统提示“根据行政许可法，您的证书将于20个工作日内颁发，您可于20个工作日后登录系统查看证书”。

国家发展改革委、商务部、市场监管总局联合发布《市场准入负面清单（2025年版）》，将民用无人驾驶航空器运营合格证核发（微型无人驾驶航空器除外）相关审批纳入清单，这也意味着，市场监管总局将对无人机运营类单位是否具备无人机运营合格证开展监管。