办理信息系统安全等级保护备案证明需要准备的材料如下：

《信息系统安全等级保护备案表》：一式两份，需加盖公章。包括《单位基本情况》（表一）、《信息系统情况》（表二）、《信息系统定级情况》（表三）和《第三级以上信息系统提交材料情况》（表四）。第二级以上信息系统备案时需提交表一、二、三；第三级以上信息系统还应当在系统整改、测评完成后 30 日内提交表四及其有关材料。

《信息系统安全等级保护定级报告》：纸质材料，一式两份，每个备案的信息系统均需提供对应的《定级报告》，且需按照模板格式填写并加盖单位签章。

专家评审意见及专家资质复印件：二级及以上系统通常需要专家评审，需提供专家评审意见及专家资质证明复印件，专家必须有相关资质。

网络与信息安全承诺书：法人负责人签字并盖公章。

营业执照复印件：企业需提供营业执照复印件，复印件应完整清晰并与原件一致。

法人身份证复印件：提供法人的身份证复印件。

被授权人身份证复印件及办理备案工作的授权委托书：如果是被授权人办理备案，需提供被授权人的身份证复印件及授权委托书。

备案单位办公地证明：如房产证、租赁合同等，用于证明备案单位的办公地点。

备案单位服务器托管协议：若服务器托管，需提供托管协议；若是使用云服务，需提供云服务商等保备案证明。

备案系统应急联系人登记表：填写备案系统的应急联系人手机号码和姓名，负责人的联系方式及姓名，并加盖公章。

单位系统拓扑图及说明：三级及以上系统备案需要，需加盖公章，清晰展示系统的网络拓扑结构及相关说明。

使用网络安全专用产品清单及检测报告：三级及以上系统需提供，列出系统中使用的网络安全专用产品，并提供相应的检测报告。

信息安全工作管理制度：加盖单位公章，包括安全管理规范、章程等，可提供电子版。

此外，不同地区可能会有一些细微的差异，建议在办理前咨询当地公安机关网安部门，以确保材料准备齐全、符合要求。